Das Kit dient zum qualitativen In-vitro-Nachweis der ORF1ab/N/S-Gene des neuartigen Coronavirus 2019-nCoV in Atemwegsproben, einschließlich oropharyngealer Abstriche, nasopharyngealer Abstriche und Sputum, und zur gleichzeitigen Durchführung einer Mutationstypisierung auf HV69-70 del.Wie in der GISAID-Datenbank berichtet, enthalten mehr als 95 % der gemeldeten Omicron-Variantensequenzen eine Deletion im HV69-70, die in PCR-Assays zu einem S-Gen-Zielversagen (SGTF) führen kann.SGTF kann als Proxy-Marker für die Suche nach Omicron verwendet werden.
Primer-Sets und FAM-markierte Sonden sind für den spezifischen Nachweis des ORF-Lab-Gens von 2019-nCoV, der VIC-markierten Sonde für das N-Gen von 2019-nCoV und der ROX-markierten Sonde für die S-Gen-HV69-70-del-Mutation von 2019-nCoV konzipiert.Das gleichzeitig mit der Testprobe extrahierte humane RNase P-Gen bietet eine interne Kontrolle zur Validierung des Nukleinextraktionsverfahrens und der Reagenzienintegrität.Die auf das menschliche RNase P-Gen gerichtete Sonde ist mit CY5 markiert.
Echtzeit-PCR-System: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex. Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;